О CMD
Центр молекулярной диагностики (CMD) – один из крупнейших лабораторно-диагностических центров в России, функционирующий на базе Центрального научно-исследовательского института Эпидемиологии Роспотребнадзора и предоставляющий пациентам и медицинским учреждениям широкий спектр лабораторно-диагностических исследований экспертного уровня по основным направлениям лабораторной диагностики.
CMD является одним из лидеров рынка лабораторных услуг и молекулярных технологий России и ближнего зарубежья, главным образом, выполняемых на основе современных молекулярно-генетических методов, таких как ПЦР в режиме реального времени, NASBA, секвенирования, пиросеквенирования, гибридизационных методов.
Мы сами разрабатываем, производим и внедряем в практическое здравоохранение свои диагностические тесты (исследования) для выявления инфекционных, наследственных и генетически обусловленных заболеваний человека, многие из которых являются уникальными и выполняются только в CMD Центрального НИИ Эпидемиологии.
Основные наши ПЦР-тесты имеют СЕ-марку в соответствии с Директивой 98/79/ЕС на производство препаратов для in vitro диагностики.
Преимущество и уникальность лаборатории CMD обусловлены научным потенциалом Центрального НИИ Эпидемиологии, который подтверждается квалификацией сотрудников активно взаимодействующих с Всемирной Организацией Здравоохранения (ВОЗ), Международными центрами по контролю за инфекционными заболеваниями, зарубежными клиниками, институтами и университетами; принимающих участие в российских и зарубежных научно-практических мероприятиях; публикующих свои работы в ведущих мировых изданиях.
Более 700 профессионалов, среди которых доценты и профессора, кандидаты и доктора медицинских наук, вносят свой вклад в улучшение качества и расширение спектра предоставляемых услуг, проводят обучение и оказывают методическую, информационную и консультационную поддержку врачам клинических специальностей, специалистам службы санитарно-эпидемиологического надзора, сотрудникам других клинико-диагностических лабораторий.
Собственная научная база позволяет CMD быстро внедрять передовые мировые достижения и собственные уникальные разработки в лабораторную медицину.
С 2008 года на базе Центрального НИИ Эпидемиологии функционируют 8 Всероссийских референс-центров по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных заболеваний. Часть функций референс-центров напрямую связана с контролем и обеспечением качества проводимых исследований молекулярными методами по всей территории Российской Федерации.
Мы одни из первых, кто в случае возникновения вспышек различных опасных инфекционных заболеваний приходит на помощь и в кратчайшие сроки может предложить их диагностику населению с помощью ПЦР-тестов, разработанных в нашем институте и валидированных на международном уровне. Так, например, мы принимали активное участие в расшифровке вспышки атипичной пневмонии (SARS) (2003 г.), птичьего гриппа (2008 г.), свиного гриппа (2009 г.), лихорадки Эбола (2014 г.) и др.
Наши специалисты активно участвуют в разработке методических рекомендаций, регламентирующих работу молекулярно-биологических лабораторий, а также нормативных и методических документов по эпидемиологии, диагностике, профилактике, лечению инфекционных болезней.
Также мы осуществляем методическое руководство и контроль качества молекулярно-диагностической деятельности лабораторий России; оказываем консультативную и практическую помощь лабораториям молекулярной диагностики медицинских учреждений, проводящих текущую и экстренную работу по предотвращению и расшифровке вспышек инфекционных заболеваний.
Наши лаборатории оснащены современным оборудованием ведущих мировых и отечественных производителей: Abbot, Roche, Bio Rad, Beckman Coulter и др. В своей работе мы используем новейшие лабораторные, информационные, медицинские и логистические технологии.
В своей деятельности мы руководствуемся принципом постоянного повышения качества предоставляемых услуг и максимального удовлетворения потребителей через многоуровневую интегрированную систему менеджмента качества (СМК). С ее помощью определяются как общие организационные и функциональные принципы работы всех подразделений, так и роль каждого сотрудника. В лабораториях CMD проводится постоянный контроль качества на основании положений и документов СМК, разработанных в соответствии с рекомендациями Международной организации стандартизации (ISO), Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), международных научных сообществ по клинической химии и гематологии и российскими нормативными документами (приказы МЗ РФ, Государственные стандарты в области лабораторной медицины).
С 2014 года CMD является первой российской медицинской лабораторией, участвующей и подтвердившей высокий уровень качества своих лабораторных исследований в Международной системе внешней оценки качества пре- и постаналитических этапов лабораторных исследований KIMMS (Key Incident Monitoring and Management Systems).
Лабораторная диагностика в CMD – это сочетание больших диагностических возможностей, точности, надежности, эффективности и скорости получения результатов с удобными современными сервисами, доступными ценами и всесторонней поддержкой в проведении диагностического обследования.
CMD Центр Молекулярной Диагностики. Медицинская лаборатория 8 (800) 707 788 1
В праздничные дни офисы CMD работают по индивидуальным графикам
Заявка на тест на коронавирус COVID-19
Диагностика гриппа, ОРВИ и COVID-19
Диагностика туберкулеза.
ТБ-фероновый тест
Тесты на антитела к COVID-19
Обследование после коронавирусной инфекции COVID-19
Клиника на Космодамианской — специализированная клиника инфекционных заболеваний
Подписывайтесь на наш канал в Telegram
более
1 000
СОТРУДНИКОВ
включая известных
ученых, работают в CMD
более
1 500
ВИДОВ АНАЛИЗОВ
доступны для клиентов
в офисах CMD
более
18 000 000
ИССЛЕДОВАНИЙ
ежегодно проводятся
в лабораториях CMD
более
4 500 000
КЛИЕНТОВ
ежегодно доверяют
свое здоровье CMD
NASBA
Антитела к ядерным антигенам (ANA), IgG, 25 антигенов
ВПЧ-ПАП-тест жидкостный
ДНК HBV, ультрачувствительное исследование
Исследование на арбовирусные инфекции (Вирус Западного Нила)
Исследование на арбовирусные инфекции (Лихорадка Денге)
Клещевые инфекции
Комплексная диагностика ОРВИ
Коронавирусы
Коэкспрессия онкобелков p16/Ki67
Острые кишечные инфекции
Пренатальный скрининг I триместра беременности
Пренатальный скрининг II триместра беременности
Программы расчёта риска преэклампсии
РНК HCV, ультрачувствительное исследование
РНК HCV/ ДНК HBV/ РНК HIV 1 и 2 типа
Эволюция COVID-19: клинико-иммунологические аспекты, диагностика, терапевтические подходы
25 января 202 года
Вирусные гепатиты: эпидемиология, диагностика и современные возможности лечения
14-15 декабря 2022 года
Диагностика и лечение урогенитальных и внутриутробных инфекций
16 ноября 2022 года
Все мероприятия
Peopletalk.ru. Голливудский метод
Работают ли инъекции для диабетиков при похудении, рассказала эндокринолог Центра молекулярной диагностики CMD Перово ЦНИИЭ Наталья Таныгина
На внешней: Новогодний сплин – как преодолеть?
Как плавно войти в рабочий ритм и избавиться от тягостных последствий после новогодних праздников, рассказал эксперт Центра молекулярной диагностики CMD ЦНИИЭ Михаил Лебедев
Российская газета.ru. Чай для интеллекта и иммунитета
Эксперты Центра молекулярной диагностики CMD ЦНИИЭ Михаил Лебедев и Марина Савкина рассказали о полезных свойствах чая
Все новости
О возможных противопоказаниях необходимо проконсультироваться со специалистом
FAQ для SMD Информационная политика
< Назад к Информационная политика Science
Обновлено: 8 декабря 2022 г.
Общая информация | Публикации | Данные | Программное обеспечение
Общая информация
В.
Когда вступил в силу SPD-41a? Влияет ли это на текущие исследования, финансируемые SMD?
A. SPD-41a вступает в силу 2 декабря 2022 года. Ожидается, что новые миссии и награды, начиная с ROSES-2023, будут полностью соответствовать SPD-41a. Эти требования будут внесены в новые заявки, контракты и соглашения по мере необходимости. Существующие миссии и гранты не обязаны принимать новое руководство, но им рекомендуется сделать это, если это возможно с имеющимися ресурсами.
В. Чем требования SPD-41a отличаются от требований, уже установленных в SPD-41?
A. Основные обновления политики в SPD-41a касаются сроков предоставления открытого доступа к публикациям, обмена исследовательским программным обеспечением, созданным за счет средств SMD, открытой разработки неограниченного программного обеспечения для миссий и открытого проведения научных семинаров и встреч.
В. Что делает SMD, чтобы уменьшить нагрузку на исследователей, которым необходимо соблюдать эту политику?
A. Эта политика была разработана для минимизации нагрузки на миссии и исследователей, финансируемых SMD, и SMD будет оказывать дополнительную поддержку посредством ряда новых и текущих инициатив. К ним относятся:
- Научная инициатива НАСА с открытым исходным кодом предоставляет рекомендации, обучение и услуги для поддержки реализации политики. В ROSES также есть запросы на поддержку науки с открытым исходным кодом, в том числе для модернизации программного обеспечения, поддержки программного обеспечения с открытым исходным кодом, разработки инструментов для поддержки открытой науки и деятельности в области открытой науки.
- На веб-сайте Политики научной информации SMD можно найти дополнительные рекомендации и ответы на часто задаваемые вопросы.
- Transform to OPen Science (TOPS) предоставит соответствующее обучение по открытой науке, а новая учебная программа OpenCore будет выпущена в 2023 году.
- В 2023 году, посвященном Году открытой науки НАСА, будет проведено дополнительное обучение и руководство.
- Затраты на соблюдение политики могут быть включены в бюджеты исследований, а дополнительные возможности финансирования SMD поддерживают внедрение методов открытой науки.
- Каждое подразделение также будет предоставлять рекомендации, связанные с обменом научной информацией, относящейся к их областям, и уже предоставляет широкий спектр возможностей, обеспечивающих открытую науку.
Программа
В.
Как это связано с новой политикой общего доступа, выпущенной OSTP в этом году?
A. SPD-41a соответствует новому меморандуму OSTP об обеспечении бесплатного, немедленного и равноправного доступа к исследованиям, финансируемым из федерального бюджета, что делает SMD лидером среди крупных федеральных исследовательских организаций в принятии последних рекомендаций по открытой науке.
В. Предоставят ли подразделения SMD дополнительные указания по этим требованиям?
А. Да. Каждое подразделение SMD выпустит обновленные политики или рекомендации не позднее выпуска ROSES-23.
В. Будут ли предложения ROSES оцениваться на основе того, насколько хорошо исследователи соблюдают применимые требования открытой науки?
A.
Планы управления данными оцениваются как часть достоинств их предложений, включая то, насколько хорошо запланированная деятельность соответствует требованиям открытой науки. SMD продолжит разрабатывать дальнейшие планы в консультации с сообществом о том, как будет применяться соответствие SPD-41a, но в настоящее время основное внимание SMD направлено на то, чтобы исследователи могли как можно проще открыто делиться результатами своих исследований.
В. Что полезно с научной точки зрения?
A. «Полезные с научной точки зрения» означают любые данные или программное обеспечение, которые могут быть использованы для понимания или воспроизведения публикации или могут быть использованы для создания нового понимания в будущем.
Причина предоставления этой информации следующая:
Воспроизводимость.
Публикации иногда могут быть неполными в описании алгоритма, а доступность исходных данных или программного обеспечения может значительно помочь в воспроизведении результатов.
Возможность повторного использования. Данные или программное обеспечение можно использовать в будущих исследованиях, чтобы ускорить развитие науки.
Примеры этого могут включать:
- Каталоги, созданные при анализе интересующих объектов
- Одноразовое программное обеспечение, применяющее исправления к набору данных
- Скрипты для дальнейшей обработки
- Электронные таблицы, содержащие макросы, которые использовались для анализа данных
- ноутбуков Jupyter, демонстрирующих рабочий процесс
В.
Что, если выполнение требований политики возложит чрезмерное бремя на следователя? Могут ли быть сделаны исключения в этих обстоятельствах?
A. В определенных обстоятельствах, когда соблюдение требований политики может создать чрезмерное бремя для следователя, может быть разрешено отклонение от политики. Ожидается, что отклонения будут редкими и будут рассматриваться в каждом конкретном случае в соответствии с процессом, описанным в Разделе IX SPD-41a. Следователи должны сначала обратиться к своему сотруднику программы или научному сотруднику программы. Примеры обстоятельств, которые могут быть рассмотрены для отклонения политики, включают: задержки из-за технических проблем, вредное влияние на работу учащихся, необоснованные затраты или внешние смягчающие обстоятельства.
В. Это все, что я должен делать?
A.
Эта политика представляет собой минимум, необходимый для обеспечения доступности научной информации, полученной в результате научной деятельности, финансируемой SMD. Подразделения SMD могут иметь свои собственные политики, соответствующие SPD-41a и предоставляющие дополнительные рекомендации для сообщества по научным исследованиям с открытым исходным кодом. Во всех аспектах исследовательскому сообществу SMD рекомендуется делать научную информацию максимально открытой. Эта политика будет обновляться по мере появления новых законов, политик НАСА или руководств.
В. Почему СПД-41а считается перспективным? Каково было обоснование применения этой политики к новым миссиям и новым грантам, начиная с ROSES-23?
A. Многие из новых политик являются дополнительными шагами к тому, что уже ожидается для миссий и грантов, и многие из наших миссий и грантов уже реализуются, если не являются ведущими, в этих практиках Open Science.
Например, модели и данные о недавнем обнаружении углекислого газа в атмосфере экзопланеты с помощью наблюдений с космического телескопа Джеймса Уэбба открыто публикуются в хранилище данных сообщества в виде машиночитаемых файлов с цифровым идентификатором объекта. Несмотря на то, что в различных областях науки о Земле и космосе есть много примеров, когда группы открыто делятся своими научными результатами, мы не хотели вводить нефинансируемые мандаты или незапланированную работу над существующими проектами с новой политикой. Таким образом, политика ориентирована на будущее.
Что касается исследовательских грантов, мы ожидаем, что те, кто начнет подавать свои предложения в программы ROSES23, будут включать план и расходы в свои бюджеты. Поскольку большинство работ начнется в 2024 году, а результаты будут опубликованы в 2025 году, это дает командам время для внедрения методов открытой науки. Руководство будет доступно в Руководстве по открытой науке и политиках подразделений.
Обучение будет доступно через TOPS для поддержки команд в обучении и внедрении методов открытой науки.
Публикации
В. Как исследователи могут публиковать свои публикации сразу после публикации, если они защищены платным доступом издателя?
A. Исследователи могут выполнить требования общедоступного доступа к публикациям несколькими способами. Для журнальных статей, в которых окончательная опубликованная статья связана с платой за подписку или доступ (т. Е. Платный доступ), авторы могут выполнить требование, поделившись своей копией окончательно принятой рукописи в репозитории, назначенном НАСА.
В.
Как поделиться своими публикациями?
A. Существует несколько способов предоставить публичный доступ к журнальным статьям, и лучший вариант зависит от того, как и где статья была опубликована. К ним относятся публикация статьи в открытом доступе в авторитетном журнале и отправка принятой рукописи в PubSpace. Дополнительную информацию см. в разделе «Как делиться публикациями» в Руководстве SMD по научным исследованиям с открытым исходным кодом.
Технические отчеты следует загружать непосредственно на сервер технических отчетов НАСА.
В. Могу ли я публиковаться с статусом Gold Open Access?
A.
Публикация вашей работы в статусе Gold Open Access, при котором опубликованная статья предоставляется в свободный доступ сразу же после публикации через веб-сайт журнала, является одним из приемлемых способов выполнения требований публичного доступа согласно SPD-41a. SMD поощряет исследователей публиковаться в авторитетных журналах в качестве открытого доступа, а расходы на публикацию в открытом доступе могут быть включены в бюджеты предложений по финансированию SMD. Дополнительную информацию см. в разделе «Публикация в открытом доступе» в Руководстве SMD по научным исследованиям с открытым исходным кодом.
В. Какие публикации Миссии необходимо сделать общедоступными?
A. Это требование распространяется на все публикации, связанные с Миссией, включая технические отчеты, рецензируемые публикации, материалы конференций, диссертации и книги.
Это не включает какую-либо документацию, на которую распространяются исключения, такие как экспортный контроль или конфиденциальная информация. Примеры публикаций, которые необходимо сделать общедоступными, включают рецензируемые рукописи, описывающие детекторы, используемые в миссии, неограниченные проектные документы из обзоров миссии и презентации на конференциях о статусе миссии. Это также включает результаты конференций или семинаров, которые в основном спонсируются миссией.
Исследования, созданные на основе дополнительных наград или грантов от миссий, будут следовать разделам SPD-41a, связанным с исследованиями (разделы III и VII). Например, финансирование исследований в результате успешных наблюдений космического телескопа Хаббл будет осуществляться в соответствии с политикой исследований в отношении доступа к публикациям, как только она будет включена в соответствующие заявки.
Рецензируемые публикации, созданные на основе данных Миссии без какого-либо финансирования SMD, не обязаны публиковаться, но такая практика приветствуется.
В. Как миссии должны делиться публикациями?
A. Поскольку важно, чтобы данные Миссии стали общедоступными как можно скорее, информация, необходимая для понимания данных Миссии, также должна быть доступна сразу после публикации. Таким образом, мы призываем Миссии делать публикации команды, описывающие Миссию, данные или аспекты Миссии, максимально открытыми.
Способы обмена публикациями Миссии включают методы, описанные в разделе «Как делиться публикациями» в SMD Open Source Science Guidance, а также размещение на веб-страницах Миссии.
Данные
В.
Какую лицензию следует использовать для моих данных?
A. Научные данные SMD должны публиковаться с нулевой лицензией Creative Commons, если нет других ограничений на данные. Это дает пользователю четкую лицензию на то, что научные данные являются всемирным общественным достоянием и что они могут свободно использовать их. В некоторых случаях могут существовать ограничения на выпуск данных из-за прав на интеллектуальную собственность, контрактных ограничений, базовых лицензий или других проблем. Если вы не уверены, обратитесь к своему юристу, который может помочь с правами на интеллектуальную собственность, или запросите разъяснения по адресу [email protected].
При условии, что научные данные были разработаны исключительно государственными служащими (без участия подрядчика, грантополучателя или партнера), предназначены ответственным проектом/миссией/задачей для широкой публики без ограничений и не имеют других ограничений (например, ограничения, налагаемые лицензиями, контрактами, правами на интеллектуальную собственность и т.
п.), данные должны публиковаться под лицензией Creative Commons Zero (CC0). Поскольку CC0 фактически передает данные в общественное достояние, необходимо позаботиться о том, чтобы обеспечить соблюдение всех критериев. Если есть какие-либо вопросы, следует обратиться за советом к вашему центральному поверенному в области ИС и/или попросить разъяснений по адресу [email protected].
В. Как насчет данных модели и моделирования?
A. Данные модели и моделирования, необходимые для проверки научных выводов, должны быть опубликованы как часть данных, опубликованных в рамках рецензируемой рукописи. Однако в настоящее время все еще предстоит разработать руководство о том, как это следует делать и какие типы данных модели и моделирования необходимо совместно использовать, и будут запрошены данные. В рамках Плана управления данными предлагающие должны описать, как они планируют делиться данными и какие типы данных будут использоваться совместно.
В. Что эта политика означает для существующих миссий, у которых есть период исключительного использования для целевых наблюдений?
A. SPD-41a применяется для новых миссий; периоды эксклюзивного использования в существующих миссиях (например, Hubble, Chandra, JWST) будут обсуждаться в каждом конкретном случае. SPD-41a не имеет приоритета над существующими международными соглашениями для таких миссий, как космический телескоп Джеймса Уэбба, которые устанавливают период исключительного использования для целевых наблюдений, и любые изменения в эти соглашения будут вноситься по согласованию с нашими партнерами. Хотя политика SMD заключается в том, что данные миссии не будут иметь периода эксклюзивного доступа, может быть период, не превышающий шести месяцев, для калибровки и проверки данных. Это дает исследователям время для проверки научного качества их целевых наблюдений и экспериментов.
SPD-41a также включает процесс для отклонений, когда требуется более длительный период времени для калибровки и проверки данных, полученных от миссий, по исключительным причинам.
В соответствии с новой политикой исследования новых грантов, финансируемых SMD, будут необходимы для того, чтобы сделать любые данные, необходимые для проверки выводов рецензируемой публикации, доступными во время публикации или по завершении финансируемого периода работы.
Программное обеспечение
В. Что говорится в политике о требованиях к сопровождению или документированию научного программного обеспечения для исследований?
A.
Требования к обслуживанию или документации научного программного обеспечения для исследований отсутствуют. Политика требует, чтобы научное программное обеспечение, разработанное при финансировании SMD в рамках гранта, было открыто доступно во время публикации рецензирования, в которой оно поддерживает, или в конце периода выполнения исследовательского гранта. Хотя поддерживать и документировать программное обеспечение полезно, в политику не было включено никаких требований из-за большого количества различных типов программного обеспечения и для минимизации нагрузки на исследователей.
В. Почему я должен делиться своим программным обеспечением?
A. Совместное использование научного программного обеспечения помогает поддерживать два основных столпа науки: воспроизводимость и использование результатов работы других.
Публикации могут быть неполными в описании лежащего в их основе алгоритма. Хотя это редко делается преднамеренно, это все же может быть проблематичным при попытке воспроизвести результаты. Доступность используемого программного обеспечения может помочь уточнить, что было написано и что было сделано.
Делясь программным обеспечением, мы также даем следующему поколению ученых четкую основу для дальнейшего развития. Это экономит время за счет повторного использования программного обеспечения или создания поверх существующего программного обеспечения.
Кроме того, совместное использование вашего программного обеспечения также позволяет более широко цитировать его. Например, те, кто использует ваше программное обеспечение, будут ссылаться на него, что повысит влияние вашей работы.
В. Я разработал программное обеспечение специально для газеты, как мне поделиться им?
A. Одноразовое программное обеспечение разрабатывается для определенной цели, например, для построения графика или записной книжки Jupyter для некоторого анализа или электронной таблицы Excel, используемой для научных расчетов. В настоящее время SMD предлагает, чтобы программное обеспечение распространялось как часть дополнительных материалов или в сервисе, который создаст DOI для материала, на который затем можно будет сослаться в публикации.
Дополнительные рекомендации доступны в разделе «Типы исследовательского программного обеспечения и ожидания в отношении совместного использования» в Руководстве по научным исследованиям с открытым исходным кодом SMD.